Merge system-optimization IR contracts and retire legacy engine adapter

docs/other/Python数值实现退役记录.md

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 当前版本仍仅提供 Windows x64 原生构建。此前已发现大型 `test-mql-8` 的 CVODE BDF 完整仿真过慢；本次删除旧实现不解决该问题，不能据组件覆盖或短时测试宣称其长时仿真已通过。详见 [组件覆盖记录](C内核组件库覆盖记录.md)。
 
 本地生成的 EXE、DLL、计时日志在 `/test/`，不提交编译产物。源码和冻结基准进入 Git，可重新生成。
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+## 远端 IR 分支集成
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+合并保留 `system-optimization` 的 IR v2 schema、Python 数据结构、内容签名和静态校验器。旧 `compile_system_ir(GenericFluidSystem)` 导出器直接依赖已删除的压力流量、机械和闭合执行计划，因此停用并返回明确的迁移提示。当前 C 生成接口是 `native_codegen.compiler.compile_native_program(network)`，尚不输出独立的 System IR v2 执行计划。
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+从远端提交 `ce353d2` 固化机械、132 状态 MQL、74 状态历史模型的 reference-only IR，保存在 `tests/data/system-ir-v2-reference.json.gz`。保留并迁移了 20 项 IR 结构、签名、索引、阶段和错误校验测试，全部通过。用于捕获参考结果的临时旧代码副本已删除。
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+CI 同步移除旧 Python 基准命令：Linux 验证元数据和 IR 合同，Windows 配置 C 工具链后运行原生回归。CI 配置已更新，本地验证与远端 CI 的实际运行结果分别记录，不把本地通过当成远端 CI 已通过。
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+## 最终本地验证
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+- 后端完整发现 280 项测试，1 项 Linux 锁定环境版本校验按配置跳过。数值、XML、IR 等检查通过；心跳测试改为等待消费确认后，对应 11 项 API 回归通过，消除依赖几毫秒固定等待的时序假设。
+- 前端 TypeScript 检查与 Vite 生产构建通过。
+- Chrome 无界面网页测试 3 项通过：C 结果、缺少旧诊断字段的结果、历史 Python 结果均可显示并在刷新后恢复。
+- `skill-test` 完整 10 s 原生求解通过，计时与设置见上文。